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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

新年开工，上海金山12个重大产业项目集中启动******

　　1月3日，上海市金山区重大产业项目集中开工活动暨大信·中信海直无人机华东总部基地项目开工仪式举行。该项目将进一步集聚发展壮大无人机特色产业，打造华东地区无人机产业创新生态高地。

　　本次集中开工主战场的大信·中信海直无人机华东总部基地项目，致力于打造国内领先的集行业级无人机生产制造、应用培训、应用运营、应用研发为一体的“软硬一体化”产业基地，助力上海民用航空无人驾驶试验区的发展。

　　该项目计划用地150亩，拟建建筑面积约16.9万平方米。项目计划总投资12.1亿元，预计项目达纲达产后,年产值13.8亿元。该项目将为华东无人机基地实现全国一流民用无人驾驶航空示范区蓄势赋能。

　　据悉，除主会场外，当日还有11个重大产业项目同时开工启动，总投资91亿元，涉及用地面积871亩，涵盖智能装备、新材料、生命健康等多个战略新兴产业领域，将为金山产业经济高质量发展培育发展新动能。

　　其中新材料集聚效应显著，本次开工的项目有6个，总投资23.1亿元，代表项目有庄臣中国制造工厂新建项目、上海艾创包装科技有限公司新建的工业用纸包装生产建设项目等。

　　高端智能装备领域的3个项目，总投资40.7亿元，占总开工投资额的42%。麦格纳汽车镜像（上海）有限公司的涂装线技术升级改造项目。项目计划总投资5000万元，作为全球第三大汽车零部件供应商麦格纳国际旗下独资子公司，本次技术升级改造后将直接带动产能产值大幅提升，推动汽车产业向高端化、智能化、绿色化迈进。

　　值得一提的是，本次开工的上海石化的热电机组清洁提效改造工程项目是中石化集团与金山区政府继去年6月弹性体项目后的再一次强强联手。该项目已列为《上海市能源发展“十四五”规划》的重点能源建设项目，项目计划总投资37.5亿元，建成后进一步锚定“双碳”目标，能效水平大幅提升，助推化工行业向绿色低碳转型。（光明日报全媒体记者颜维琦 通讯员 魏娜）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）